O Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO) da FZEA-USP, com área de Concentração em Qualidade e Produtividade Animal, atua desde 1993 (Mestrado) e 2001 (Doutorado e Doutorado Direto) na formação de profissionais com conhecimentos diferenciados, capacidade crítica e mentalidade inovadora, aptos a atuar nos diferentes segmentos ligados a produção animal. Desde sua criação já foram titulados mais de 421 mestres e 230 doutores, que atuam em empresas nacionais e internacionais de diferentes ramos do agronegócio, bem como em instituições de ensino e pesquisa, incluindo universidades públicas e particulares e institutos públicos de pesquisa. A inscrição ao Processo Seletivo para candidatos ao PPGZOO segue fluxo contínuo, ocorrendo durante o ano todo.

A área de concentração do PPGZOO, denominada “Qualidade e Produtividade Animal”, congrega diversas linhas de pesquisa contemplando pesquisas básicas e aplicadas relacionadas às diferentes áreas e espécies de interesse zootécnico. Desde sua criação, o PPGZOO é caracterizado pela multidisciplinaridade de seu corpo docente e de linhas de pesquisa. Como único programa de pós-graduação existente na FZEA até o ano de 2009, ele absorveu docentes de diversas áreas relacionadas à produção animal, os quais têm atuado nas seis diferentes linhas de pesquisa do PPGZOO.

A primeira defesa de mestrado do PPGZOO ocorreu em 08/10/1996 com a dissertação “Estudo da inclusão de fibra na dieta de bezerros da raça holandesa”, do aluno Andrei Kimura Marcondes de Castro, orientado do Prof. Dr. Marcus Antônio Zanetti, enquanto que a primeira defesa de tese de doutorado foi realizada no dia 19/12/2003, sob o título “Efeito da separação de larvas de Pacu (Piaractus mesopotamicus) por tamanho, na seleção e no crescimento”, desenvolvida por Sandoval dos Santos Júnior, sob orientação do Prof. Dr. Francisco Javier Hernandez Blazquez.